Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms