Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nicn1Q9CQM0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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