Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE0

Rnf138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138Q9CQE0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf138Q9CQE0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf138Q9CQE0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms