Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CQC3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CQC3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CQC3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQC3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQC3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CQC3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms