Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pkp2Q9CQ73 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp2Q9CQ73 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms