Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpa3Q9CQ71 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpa3Q9CQ71 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms