Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pole4Q9CQ36 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pole4Q9CQ36 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pole4Q9CQ36 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pole4Q9CQ36 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pole4Q9CQ36 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pole4Q9CQ36 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pole4Q9CQ36 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pole4Q9CQ36 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole4Q9CQ36 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole4Q9CQ36 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole4Q9CQ36 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole4Q9CQ36 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms