Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chmp3Q9CQ10 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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