Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bhlhe41Q99PV5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms