Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim26Q99PN3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim26Q99PN3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms