Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrbp1Q99PL5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrbp1Q99PL5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrbp1Q99PL5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrbp1Q99PL5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrbp1Q99PL5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrbp1Q99PL5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrbp1Q99PL5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrbp1Q99PL5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrbp1Q99PL5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrbp1Q99PL5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rrbp1Q99PL5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rrbp1Q99PL5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rrbp1Q99PL5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rrbp1Q99PL5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rrbp1Q99PL5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rrbp1Q99PL5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rrbp1Q99PL5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rrbp1Q99PL5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrbp1Q99PL5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms