Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms