Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubqln4Q99NB8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
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Ubqln4Q99NB8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Ubqln4Q99NB8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Ubqln4Q99NB8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Ubqln4Q99NB8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Ubqln4Q99NB8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Ubqln4Q99NB8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ubqln4Q99NB8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ubqln4Q99NB8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln4Q99NB8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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