Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pcgf6Q99NA9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcgf6Q99NA9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms