Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atoh8Q99NA2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms