Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Mrpl3Q99N95 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl3Q99N95 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl3Q99N95 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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