Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brms1Q99N20 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms