Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf17Q99MV7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms