Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprtQ99M80 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprtQ99M80 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprtQ99M80 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprtQ99M80 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprtQ99M80 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprtQ99M80 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprtQ99M80 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprtQ99M80 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprtQ99M80 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprtQ99M80 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprtQ99M80 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprtQ99M80 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprtQ99M80 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PtprtQ99M80 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprtQ99M80 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprtQ99M80 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PtprtQ99M80 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprtQ99M80 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PtprtQ99M80 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PtprtQ99M80 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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