Protein–RNA interactions for Protein: Q99M28

Rnps1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnps1Q99M28 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnps1Q99M28 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnps1Q99M28 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnps1Q99M28 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnps1Q99M28 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnps1Q99M28 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnps1Q99M28 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnps1Q99M28 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnps1Q99M28 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnps1Q99M28 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnps1Q99M28 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rnps1Q99M28 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rnps1Q99M28 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rnps1Q99M28 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rnps1Q99M28 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rnps1Q99M28 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnps1Q99M28 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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