Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bp5lQ99LH9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp5lQ99LH9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms