Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp16Q99LG0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp16Q99LG0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms