Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lysmd3Q99LE3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lysmd3Q99LE3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lysmd3Q99LE3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lysmd3Q99LE3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lysmd3Q99LE3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lysmd3Q99LE3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lysmd3Q99LE3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lysmd3Q99LE3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lysmd3Q99LE3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lysmd3Q99LE3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lysmd3Q99LE3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lysmd3Q99LE3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms