Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmp1Q99KU0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms