Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf34Q99KR6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms