Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms