Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TrabdQ99JY4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TrabdQ99JY4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms