Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms