Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pacsin3Q99JB8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms