Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ophn1Q99J31 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ophn1Q99J31 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ophn1Q99J31 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ophn1Q99J31 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ophn1Q99J31 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ophn1Q99J31 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ophn1Q99J31 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ophn1Q99J31 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ophn1Q99J31 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ophn1Q99J31 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ophn1Q99J31 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ophn1Q99J31 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ophn1Q99J31 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ophn1Q99J31 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ophn1Q99J31 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ophn1Q99J31 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ophn1Q99J31 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ophn1Q99J31 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms