Protein–RNA interactions for Protein: Q99J25

Mrm1, rRNA methyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrm1Q99J25 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Mrm1Q99J25 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrm1Q99J25 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms