Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctu1Q99J10 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctu1Q99J10 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms