Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbox1Q924Y0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbox1Q924Y0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbox1Q924Y0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbox1Q924Y0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbox1Q924Y0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbox1Q924Y0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbox1Q924Y0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbox1Q924Y0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbox1Q924Y0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbox1Q924Y0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbox1Q924Y0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbox1Q924Y0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Bbox1Q924Y0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbox1Q924Y0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms