Protein–RNA interactions for Protein: Q923W1

Tgs1, Trimethylguanosine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgs1Q923W1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgs1Q923W1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgs1Q923W1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms