Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TardbpQ921F2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms