Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Odf3Q920N1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Odf3Q920N1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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