Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin3bQ91ZU9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin3bQ91ZU9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms