Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pde6cQ91ZQ1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms