Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc49Q91YK0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc49Q91YK0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc49Q91YK0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc49Q91YK0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms