Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl3Q91YH5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms