Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Basp1Q91XV3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Basp1Q91XV3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms