Protein–RNA interactions for Protein: Q91WS2

Nlrp6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp6Q91WS2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp6Q91WS2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp6Q91WS2 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms