Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csde1Q91W50 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms