Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsmce2Q91VT1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms