Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn8Q91VA3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn8Q91VA3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms