Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cabp4Q8VHC5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cabp4Q8VHC5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms