Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc71Q8VEG0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc71Q8VEG0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms