Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cul7Q8VE73 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul7Q8VE73 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms