Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VDP2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VDP2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms