Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d2Q8VD57 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d2Q8VD57 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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